NADH و FADH2 حمل پروتون (H +) و الکترون (e-) که به سمت زنجیره انتقال الکترون در غشا قرار گرفته است.انرژی از انتقال الکترون ها در زنجیره حمل و نقل پروتون در سراسر غشاء و ایجاد یک شیب الکتروشیمیایی و یا نیروی محرک پروتون است. در پایان از سیستم انتقال الکترون، پروتون، الکترون و مولکول های اکسیژن ترکیب برای تشکیل آب است. به عنوان پروتون جمع آوری به دنبال پشت شیب الکتروشیمیایی در سراسر غشاء از طریق مجموعه ATP سنتاز، حرکت پروتون ها (نیروی محرک پروتون) فراهم می کند انرژی لازم برای سنتز ATP از ADP و فسفات است.